Тихонов в июне 2016 года возглавил красноярский «Енисей». Под его руководством команда заняла третье место в первенстве ФНЛ и получила право сыграть в стыковых матчах за выход в премьер-лигу против тульского «Арсенала». По сумме двух игр тульский клуб сохранил прописку в РФПЛ.
«Андрей Тихонов возглавит самарские 'Крылья Советов', контракт тренера с 'Енисеем' завершается 1 июня. Самара не чужой город для Андрея Валерьевича, он играл в 'Крыльях' и уже работал там тренером, это стало одной из причин, по которой он отказался от продлений контракта в Красноярске», - рассказал собеседник агентства.
«Крылья Советов» по итогам чемпионата России заняли 15-е место в таблице РФПЛ и вылетели в Футбольную национальную лигу (ФНЛ).